在新时代背景下，我国全面深化改革进入深水区，任务艰巨而复杂。在这个过程中，我们必须深刻认识并妥善处理好一些关键性的重大关系，以确保改革能够顺利推进并取得实效。

首先，需要正确处理政府与市场的关系。一方面，政府应当充分发挥其宏观调控的作用，为市场经济的发展提供良好的制度环境；另一方面，也要尊重市场规律，减少不必要的行政干预，让市场在资源配置中起决定性作用。只有这样，才能实现政府职能转变，激发社会活力。

其次，城乡之间的协调发展也是不可忽视的重要方面。随着城镇化进程加快，如何缩小城乡差距、促进城乡一体化发展成为一项重要课题。这不仅涉及到基础设施建设、公共服务均等化等问题，还需要从政策层面给予支持，鼓励资本、人才向农村流动，增强农村地区的自我发展能力。

再次，经济发展与生态保护之间的平衡同样至关重要。长期以来，“先污染后治理”的发展模式给生态环境带来了严重破坏。因此，在今后的发展中，必须坚持绿色发展理念，将环境保护贯穿于经济社会发展的全过程，通过技术创新等方式提高资源利用效率，减少对自然环境的影响。

此外，还需关注不同群体间利益分配的公平性问题。随着经济结构转型和社会结构变化，各类群体的利益诉求日益多样化。这就要求我们在制定相关政策时充分考虑各方需求，努力寻求最大公约数，构建和谐稳定的社会环境。

最后，对外开放与自主创新之间也需要找到合适的结合点。在全球化趋势下，加强国际合作交流固然重要，但更重要的是立足自身实际，加大科技研发投入力度，培养高水平人才队伍，提升自主创新能力，从而在全球竞争中占据有利地位。

总之，全面深化改革是一项系统工程，涉及方方面面。只有准确把握上述几个方面的重大关系，并根据实际情况灵活调整策略，才能推动各项事业不断向前发展，最终实现中华民族伟大复兴的目标。